在所有的专业设计结束后，可以开始模拟计算。模拟计算部分有三个步骤，首先是计算分析配置，然后划分网格，最后进行计算。
1.计算配置：
计算模型选择：根据《绿色建筑设计评价标准》规定湍流模型选择标准k-eps模型，软件默认为标准模型，同时内置了其他多种模型，供设计师选择。
计算精度有两种设置模式：一种是粗算，另外一种是精算。粗算收敛精度为0.001，迭代步数为250步，精算的收敛精度是0.0001，迭代步数是500。一般在方案阶段选择粗算，在施工图详细设计和报审阶段选择精算。

2.分析配置
分析配置主要内容为设置评分规则、标准指标及限值、高标指标及限值等设置。
评分规则主要为如图所示三种情况下评分方式的选择，软件设置标准配置，即当单栋建筑存在多个评价范围时，按照所有范围的平均值评分；当项目存在多个建筑时，按照所有建筑的最不利值评分；当项目为商住两用时，公建和居建分别单独评分。

指标及限值设置：软件根据标准设定默认相应指标限值，设计师只需要根据项目需要进行勾选。居住建筑强制审查窗地面积比例，公共建筑强制审查换气次数，空气龄和风速指标为满足人员舒适度的推荐审查指标，不影响项目判断评分。